GeoJSON הוא פורמט מודרני ל-GIS לאינטרנט ולממשקי API, ואילו Shapefile הוא התקן הקלאסי של GIS שולחני. הבחירה תלויה במקום שבו תשתמש בנתונים.
| קריטריונים | GeoJSON | Shapefile |
|---|---|---|
| תאימות אינטרנט | ✓ | ✗ |
| GIS שולחני | ✓ | ✓ |
| קובץ יחיד | ✓ | ✗ |
| ביצועים בנתוני עתק | ✗ | ✓ |
| קריא לאדם | ✓ | ✗ |
לאפליקציות אינטרנט, ממשקי API, Leaflet/Mapbox/OpenLayers, עיבוד ב-Python/JS.
ל-ArcGIS, QGIS, מערכות ממשלתיות, מערכי נתונים גדולים, תהליכי עבודה ותיקים.